El Sarampión causará alteraciones en la epigenómica de las células que infecte ya que el virus del sarampión se replica en el epitelio de las vías respiratorias y las células resultaran alteradas o destruidas y causando la formación de cuerpos de inclusión en el núcleo y el citoplasma. Produce alteraciones en el lecho capilar causando así lesiones exantemáticas ya que cuando el virus llega a cualquier tejido produce una reacción mononuclear con focos inflamatorios distribuidos por todo el organismos y dentro de estos focos se forman células gigantes multinucleadas con cuerpos de inclusión intranucleares e intracitoplasmáticos. En el sistema nervioso central se puede presentar una encefalitis sarampiosa caracterizada por edema congestivo y hemorragias petequiales difusas con un grave ataque a las células neuronales causando estados degenerativos. También infecta a los linfocitos T y B, monocitos, leucocitos y polimorfonucleares, depresión de la inmunidad celular, disminución en la producción de interleucina 12 de monocitos y macrófagos y sobre los linfocitos B suprime la síntesis de inmunoglobulinas (Ig) y la actividad de las células citolíticas naturales.
El genoma de los virus salvajes del
sarampión es una molécula de RNA de 15.984 nucleótidos, codifica por las
proteínas estructurales: N (nucleocápsida), P (fosfoproteína), L (polimerasa),
M (matriz), H (hemaglutinina) y F (de fusión) que se incorporan a las
partículas víricas, y otras no estructurales V y C que se encuentran solamente
en las células infectadas.

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